MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901 chromosome

Total Repeats: 44459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007503	TGAAAA	2	12	220	231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	78043997
2	NC_007503	ACCA	2	8	238	245	50 %	0 %	0 %	50 %	78043997
3	NC_007503	A	6	6	245	250	100 %	0 %	0 %	0 %	78043997
4	NC_007503	CGG	2	6	252	257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043997
5	NC_007503	CTT	2	6	275	280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043997
6	NC_007503	GGCG	2	8	300	307	0 %	0 %	75 %	25 %	78043997
7	NC_007503	CGG	2	6	324	329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043997
8	NC_007503	TTTC	2	8	441	448	0 %	75 %	0 %	25 %	78045102
9	NC_007503	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045102
10	NC_007503	TGT	2	6	509	514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045102
11	NC_007503	TTA	2	6	515	520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045102
12	NC_007503	A	6	6	524	529	100 %	0 %	0 %	0 %	78045102
13	NC_007503	A	6	6	540	545	100 %	0 %	0 %	0 %	78045102
14	NC_007503	GTAA	2	8	567	574	50 %	25 %	25 %	0 %	78045102
15	NC_007503	A	7	7	573	579	100 %	0 %	0 %	0 %	78045102
16	NC_007503	GTT	2	6	591	596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78045102
17	NC_007503	AAG	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78045102
18	NC_007503	GCTTT	2	10	638	647	0 %	60 %	20 %	20 %	78045102
19	NC_007503	ATG	2	6	700	705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045102
20	NC_007503	TA	4	8	733	740	50 %	50 %	0 %	0 %	78045102
21	NC_007503	ATTAA	2	10	741	750	60 %	40 %	0 %	0 %	78045102
22	NC_007503	TCGA	2	8	759	766	25 %	25 %	25 %	25 %	78045102
23	NC_007503	CTT	2	6	787	792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043459
24	NC_007503	CTT	2	6	851	856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78043459
25	NC_007503	AGG	2	6	988	993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043459
26	NC_007503	TAT	2	6	1093	1098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043134
27	NC_007503	A	8	8	1203	1210	100 %	0 %	0 %	0 %	78043134
28	NC_007503	CAG	3	9	1232	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043134
29	NC_007503	GTT	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043134
30	NC_007503	TATTT	2	10	1415	1424	20 %	80 %	0 %	0 %	78043134
31	NC_007503	GCT	2	6	1436	1441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043134
32	NC_007503	CCAA	2	8	1491	1498	50 %	0 %	0 %	50 %	78043134
33	NC_007503	TTATG	2	10	1510	1519	20 %	60 %	20 %	0 %	78043134
34	NC_007503	CGG	2	6	1554	1559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043134
35	NC_007503	GGT	2	6	1576	1581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043134
36	NC_007503	ATT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043134
37	NC_007503	CAG	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78043134
38	NC_007503	TCAA	2	8	1617	1624	50 %	25 %	0 %	25 %	78043134
39	NC_007503	TTG	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78043134
40	NC_007503	AGC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045166
41	NC_007503	GATC	2	8	1734	1741	25 %	25 %	25 %	25 %	78045166
42	NC_007503	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78045166
43	NC_007503	AG	3	6	1913	1918	50 %	0 %	50 %	0 %	78045166
44	NC_007503	ATC	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045166
45	NC_007503	TTAA	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	78045166
46	NC_007503	AT	3	6	2003	2008	50 %	50 %	0 %	0 %	78045166
47	NC_007503	CGG	2	6	2046	2051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78045166
48	NC_007503	ATT	2	6	2052	2057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78045166
49	NC_007503	ACG	2	6	2081	2086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78045166
50	NC_007503	A	6	6	2089	2094	100 %	0 %	0 %	0 %	78045166
51	NC_007503	GA	3	6	2178	2183	50 %	0 %	50 %	0 %	78045166
52	NC_007503	ATC	2	6	2187	2192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78045166
53	NC_007503	TAA	2	6	2260	2265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78045166
54	NC_007503	ATG	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
55	NC_007503	AGG	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78044593
56	NC_007503	A	6	6	2454	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	78044593
57	NC_007503	CAAAG	2	10	2476	2485	60 %	0 %	20 %	20 %	78044593
58	NC_007503	CTG	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
59	NC_007503	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
60	NC_007503	CGG	2	6	2631	2636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78044593
61	NC_007503	T	6	6	2721	2726	0 %	100 %	0 %	0 %	78044593
62	NC_007503	GAC	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044593
63	NC_007503	A	6	6	2837	2842	100 %	0 %	0 %	0 %	78044593
64	NC_007503	A	6	6	2858	2863	100 %	0 %	0 %	0 %	78044593
65	NC_007503	TGA	2	6	2919	2924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
66	NC_007503	ATA	2	6	2962	2967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044593
67	NC_007503	CTT	2	6	2983	2988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	78044593
68	NC_007503	CCG	2	6	3029	3034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	78044593
69	NC_007503	TTA	2	6	3070	3075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
70	NC_007503	TTA	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
71	NC_007503	A	7	7	3091	3097	100 %	0 %	0 %	0 %	78044593
72	NC_007503	ATT	2	6	3146	3151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
73	NC_007503	TCG	2	6	3179	3184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
74	NC_007503	TGT	2	6	3279	3284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044593
75	NC_007503	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
76	NC_007503	GAT	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
77	NC_007503	TAAT	2	8	3332	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	78044593
78	NC_007503	TTG	2	6	3352	3357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	78044593
79	NC_007503	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044593
80	NC_007503	TGC	2	6	3377	3382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044593
81	NC_007503	GGTAA	2	10	3385	3394	40 %	20 %	40 %	0 %	78044593
82	NC_007503	AGGA	2	8	3512	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	78044593
83	NC_007503	TTA	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044593
84	NC_007503	TGA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78044593
85	NC_007503	ATG	2	6	3776	3781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043339
86	NC_007503	TGG	2	6	3909	3914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043339
87	NC_007503	GTG	2	6	3928	3933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043339
88	NC_007503	CGG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043339
89	NC_007503	AGG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	78043339
90	NC_007503	A	7	7	4081	4087	100 %	0 %	0 %	0 %	78043339
91	NC_007503	ATT	3	9	4243	4251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043339
92	NC_007503	CGG	2	6	4277	4282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	78043339
93	NC_007503	AAC	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043339
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95	NC_007503	ATGT	2	8	4672	4679	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
96	NC_007503	AAT	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043339
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99	NC_007503	TGC	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78043339
100	NC_007503	AAAGAA	2	12	4939	4950	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	78043339
101	NC_007503	TGAT	2	8	4991	4998	25 %	50 %	25 %	0 %	78043339
102	NC_007503	ACT	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043339
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104	NC_007503	A	6	6	5324	5329	100 %	0 %	0 %	0 %	78043339
105	NC_007503	GAT	2	6	5356	5361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	78043339
106	NC_007503	AAC	2	6	5411	5416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78043339
107	NC_007503	TAA	2	6	5436	5441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043339
108	NC_007503	A	6	6	5452	5457	100 %	0 %	0 %	0 %	78043339
109	NC_007503	ATTT	2	8	5599	5606	25 %	75 %	0 %	0 %	78043339
110	NC_007503	AG	3	6	5607	5612	50 %	0 %	50 %	0 %	78043339
111	NC_007503	GAAGC	2	10	5636	5645	40 %	0 %	40 %	20 %	78043339
112	NC_007503	T	7	7	5653	5659	0 %	100 %	0 %	0 %	78044839
113	NC_007503	A	6	6	5688	5693	100 %	0 %	0 %	0 %	78044839
114	NC_007503	TAT	2	6	5711	5716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044839
115	NC_007503	TTA	2	6	5720	5725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78044839
116	NC_007503	TGAAAA	2	12	5731	5742	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	78044839
117	NC_007503	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	78044839
118	NC_007503	ACT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044839
119	NC_007503	A	7	7	5932	5938	100 %	0 %	0 %	0 %	78044839
120	NC_007503	AACG	2	8	5980	5987	50 %	0 %	25 %	25 %	78044839
121	NC_007503	TAA	2	6	5994	5999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78044839
122	NC_007503	GC	3	6	6004	6009	0 %	0 %	50 %	50 %	78044839
123	NC_007503	G	6	6	6121	6126	0 %	0 %	100 %	0 %	78044839
124	NC_007503	GAA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	78044839
125	NC_007503	A	7	7	6169	6175	100 %	0 %	0 %	0 %	78044839
126	NC_007503	GCA	2	6	6185	6190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	78044839
127	NC_007503	AAC	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	78044839
128	NC_007503	TAC	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78044839
129	NC_007503	TGG	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78044839
130	NC_007503	A	6	6	6272	6277	100 %	0 %	0 %	0 %	78044839
131	NC_007503	ATA	2	6	6478	6483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	78043660
132	NC_007503	ATT	2	6	6492	6497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	78043660
133	NC_007503	CCAA	2	8	6505	6512	50 %	0 %	0 %	50 %	78043660
134	NC_007503	ACT	2	6	6531	6536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	78043660
135	NC_007503	A	6	6	6576	6581	100 %	0 %	0 %	0 %	78043660
136	NC_007503	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	78043660
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138	NC_007503	AT	3	6	6660	6665	50 %	50 %	0 %	0 %	78043660
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